本地优先的科研/工作流程管理桌面应用（Tauri 2）。发布目标：Windows x64 + macOS 12+（universal：Apple Silicon + Intel，DMG）——macOS 适配代码已入库，DMG 需在 macOS 机构建（流程见 docs/release.md §3）。把手写「思路整理」工作流数字化：空间 → 项目 → 任务三级层级 + 双层上下文（项目整体上下文 / 任务上下文）+ 周文档。
第二步（已规划、未开始）：人只说自然语言，agent 维护整个项目地图——口述新任务/新项目/任务转折即可，agent 经 MCP 工具接口执行并定时产出日报/周报。
M3 完成 + 种子发布加固（2026-09-11，M1–M3 全部落地并实机验证）：数据落盘（Markdown 文件树）、活动日志、文件监听、收件箱、今日视角、终端面板、数据目录初始化、周文档一键生成、全文搜索、项目归档、markdown 预览之上，按发布前审阅补齐数据安全九项：事务式可恢复写入、单实例、外部编辑冲突防护、每日快照健康（git 缺失界面可见）、未保存草稿退出保护、周文档覆盖确认、周报正确性修正、watcher 路径归一化、种子手册（隐私边界 + 脱敏反馈模板）。macOS 实机验证完成（2026-09-12，PR #3）：universal DMG（x86_64+arm64）、Finder 启动 PATH、应用内终端三件套、冲突/快照/.trash/单实例全矩阵通过；修复 macOS 数据层初始化 bug（fs 插件点文件作用域）；确认 macOS 15+ 无「右键打开」Gatekeeper 通道，安装指引已按系统版本分流。下一步：干净 Windows 环境实测 → release tag → 受控种子版；随后第二步阶梯 2a。计划见 PLAN.md。
| 文件 | 内容 |
|---|---|
| PLAN.md | 需求 + 技术计划（唯一事实来源） |
| AGENTS.md | AI agent 工作上下文：关键决策、数据规范、协作约定 |
| PART2.md | 第二步（agent 时代）技术报告：2a–2d 调研、选型、风险与排期 |
| UI.md | M1 界面实现规格（自包含，供外部实现；含数据访问接口契约与验收清单） |
| docs/seed-manual.md | 种子测试手册：安装/SmartScreen、数据与快照、并发规则、隐私说明与脱敏反馈模板 |
| docs/release.md | 发布流程与边界：release/ 产物规范、版本规则、每次发版的门槛清单与数据安全/隐私红线 |
- React 19 + Vite + Tailwind v4（SPA；按 UI.md 契约集成外部交付的 UI，剥离其 SSR/登录/数据库）
- Tauri 2 桌面壳（plugin-fs / plugin-shell / plugin-opener / single-instance / global-shortcut；生产线启用 CSP，见 docs/release.md §5）
- 数据访问统一走
src/dataAccess.ts接口（UI.md 第 2 节契约）：浏览器 dev → MockDataAccess；Tauri 桌面 → StorageDataAccess（Markdown 文件树落盘） - 数据层
src/storage/：纯核心core.ts（无 Tauri API）+ IO 适配器fsAdapter.ts（plugin-fs）+ 事务式写入atomicWrite.ts+ 每日快照健康snapshot.ts；同一核心配node:fs即成 2b 阶段 MCP server（tests/storageNode.test.ts的适配器即雏形） - Vitest 守护写回契约与数据安全（宽松读/规范写/保留未知字段/外部冲突防护/软删除/中断恢复）；CI 见
.github/workflows/ci.yml - 终端面板：
tauri-plugin-shell+@xterm/xterm，经 AgentRunner 接口抽象（第二步对话面板与终端共用后端） - 数据：Markdown 文件树 + YAML frontmatter，数据目录即 agent 工作区（
AGENTS.md/.mcp.json/settings.yaml），可用 Obsidian / git 直接操作；删除进.trash/可恢复
UI 布局：左侧栏（空间/项目树）｜中间展示区｜底部可开关面板（第一阶段内置终端，第二步 agent 对话）｜右侧可开关侧边栏（详情/上下文编辑）。
npm install
npm run dev # 浏览器预览（mock 数据）
npm test # vitest：storage 写回契约 + 生命周期
npm run build # tsc + vite build桌面端（Tauri 2，数据落盘为 Markdown 文件树）：
npm run tauri dev # 需 Rust 工具链；Windows 本机构建环境见 AGENTS.md「当前状态」数据目录默认 ~/ResearchThread/，首次启动自动初始化（目录骨架、AGENTS.md、settings.yaml、.mcp.json、git init）。